Da es bei höheren FPS lauter wird gehe gehe ich, wie eingangs schon vermutet, davon aus das es die Spulen der GPU sind. Das kann in manchen Fällen schon wunderlich klingen.
Das "Spulenfiepen" haben fast alle GPU's. Im Normalfall allerdings erst bei sehr hohen FPS.
Kannst ja zum Test mal die GPU ausbauen und CS:GO über die Onboard Grafik laufen lassen.
Da du, wenn ich das richtig verstanden habe, das Netzteil schon vorher hattest gehe ich mal davon aus das es soweit in Ordnung ist. (Die Last ist zwar ohne die GPU nicht so hoch, aber ich gehe davon aus das die Geräusche von der GPU kommen)
Google mal nach "Framelimitter", mit solchen Programmen kann man die FPS begrenzen. Riva Tuner Statistic Server (RTSS) kanns auch.